Лейшмания паразитінің геномы Фриедлин деформациясының негізі

Жұмыс түрі: Материал
Тегін: Антиплагиат
Көлемі: 29 бет
Таңдаулыға:

ҚАЗАҚСТАН РЕСПУБЛИКАСЫНЫҢ БІЛІМ ЖӘНЕ

ҒЫЛЫМ МИНСИТРЛІГІ

ӘЛ-ФАРАБИ АТЫНДАҒЫ ҚАЗАҚ ҰЛТТЫҚ УНИВЕРСИТЕТІ

Биология факультеті

Биотехнология, биохимия, өсімдіктер физиологиясы кафедрасы

Бітіру жұмысы

ПРОТОЗОА КЕЙБІР ГЕНОМДАР ҰЙЫМДАСУЫНЫҢ САЛЫСТЫРМАЛЫ ТАЛДАУ

Орындаған 4 курс студенті Ыбрайқожа Н. П.

(қолы, күні)

Ғылыми жетекшісі Атамбаева Ш. А.

б. ғ. к., доцент (қолы, күні)

Нормоконтроллер Оразова С. Б.

б. ғ. к., ассистент (қолы, күні)

Кафедра меңгерушісінің

рұқсатымен қорғауға жіберілген

б. ғ. д., профессор Карпенюк Т. А.

(қолы, күні)

Алматы, 2010

МАЗМҰНЫ

КІРІСПЕ 4

КІРІСПЕ 4:

1ӘДЕБИЕТКЕ ШОЛУ 5

1. 1 Protozoa жалпы сипаттама 5

1. 2 Protozoa түрлерінің гендеріне сипаттама 8

1. 3 Генетикалық тізбекті анализдеу 12

1. 4 Ағзалардың гендердің экзон-интрондық ұйымдасуын

салыстырмалы талдау 13

КІРІСПЕ 4: 2 ЗЕРТТЕУ МАТЕРИАЛДАРЫ ЖӘНЕ ӘДІСТЕРІ 14

КІРІСПЕ 4: 3 ЗЕРТТЕУ НӘТИЖЕЛЕРІ ЖӘНЕ ОЛАРДЫ ТАЛДАУ СИПАТТАУ 15

КІРІСПЕ 4: ҚОРЫТЫНДЫ 25

КІРІСПЕ 4: ПАЙДАЛАНЫЛҒАН ӘДЕБИЕТТЕР ТІЗІМІ 26

КІРІСПЕ

Биоинформатика - биология ғылымының бір саласы. Биоинформатика саласында компьютер технологиясын қолданады. Биоинформатикада кез-келген биологиялық ақпаратты компьютер арқылы өңдеуге болады. Себебі биологиялық макромолекулалардың тәжірибелік нәтижелерін компьютер қолданып биологиялық маңызды ақпарат алуға болады. Биоинформатика және есептеуші биология көп жерде синоним ретінде қолданылады. Кез келген есептеуші әдістерді қолдану биоинформатика болып саналмайды. Мысалға математикалық моделдеу, бұл биоинформатика емес. Биоинформатика негізінен қолданбалы математика, статистика, информатика әдістерін қолданады. Есептеуші биологияның зерттеулері жйелі биологиямен сәйкес келе бермейді. Осы бағыттағы ғылымдардың негізгі күші геномдарды зерттеуге, белок молекуласын анализдеу және болжау, белок молекуласының басқа молекулалармен байланысын анализдеу және болжауда, жұмсалуда. [1]

Биоинформатика және оның әдістері биохимияда және биофизикада қолданылады. Негізгі жол биоинформатикада ол қиын оралған ДНҚ молекулаларындағы және белоктардағы ақпараттарды математикалық құралдармен алу болып табылады.

Plasmodium falciparum, Dictyostelium discoideum ағзаларын интрондар мен экзондардын үзындықтарындағы айырмашылық гендердегі интрондардын санына байланысты ма жоқ па, соны анықтау маңызды. Осыған байланысты біз, Р. falciparum, D. discoideum гендеріндегі интрондар мен экзондардын ұзындыктарынның өзгеруін анализдеп, олардағы әр түрлі интрондардын түрлерін, оның ішінде ұзындықтарынан ерекшелігі барларын анықтадық. [2]

1 ӘДЕБИЕТКЕ ШОЛУ

1. 1 Protozoaларға жалпы сипаттама

Бір жасушалы организмдердің атқаратын қызметтері көп жасушаларға ұқсайды, қоректенеді, қозғалады, көбеиеді. Олардың көп жасушалардың органдары атқаратын қызыметтерін, бір жасушасы жүзеге асырады. Бір жасушалы жануарлардың басқаларына ұқсамайтындықтан оларды бір патшалықастыға бөлген. Қарпайымдылардың типіне 15000 жануар түрі жатады, олар теңіздерде, тұшы суларда топрақта кездеседі. Бос күйінде және паразиттік түрде кездеседі. [3] Олардың қауыпты аурулар туғызатын паразиттік формалары көп кездеседі. Қарпайымдылардың денесі бір жасушадан тұрады. Пішіні әртүрлі болады. Олардың пішіні тұрақты, сәулелі, екі жақты симметриялы немесе тұрақты пішіні тіпті болмауы мүмкін. Мысалы амеба. Қарапайымдылардың денесінің ұзындығы 2-4мк ден 1, 5мм дейін кездеседі, кейбір особьтары 5мм ал тамыр-аяқтылар дяметрі 3см жетеді. Қарапайымдылардың денесі цитоплазма мен ядродан тұрады. Цитоплазманың сырты цитоплазмалық мембранамен қоршалады, оның ішіне митохондрия, рибосома, эндо плазмалық тор, гольджи аппарат органоиттары орналасды. Қарапайымдыларда бір немесе бірнеше ядро болады. Ядроның бөлніу түрі митоз. Жынысты көбейуі түрінде кездеседі. Ол зиготта қалыптасуымен байланысты. Қарапайымдылардың қыймыл-қозғалысын талшықтар, кірпікшелер, жалған аяқтар атқарады немесе тіпті болмайды. Қарапайымдылар көбінесе басқа жануарлар патшалығының өкілдері сияқты гетеротрофты, бірақ олардың арасында да автотрофты түрлері кездеседі. [4]

Қарапайымдылардың қоршаған ортаың қолайсыз жағдайына төзімділігінің ерекшелігі инцистену яғни циста түзу қабілеті. Циста түзілу кезінде қимыл-қозғалыс органоидтары жойылады, көлемі азаяды пішіні домалақтанады, жасуша қалың қабықша түзеді. Ол тыныштық күйге түседі де, қолайлы жағдай пайда болған кезде қалыпты активті өмірге оралады. Инцистену қабілеті қорғаныс қасиетіне ғана емес, паразиттердің таралуына да әсері көп. Кейбір қарапайымдылар овоциста түзеді және көбейу процесінде спороциста түзеді.

Қарапайымдылардың тіршілік ортасы әртүрлі болып келеді. Олар теңіздер, тұщы сулар, дымқыл топырақта да мекендейді.

Қарапайымдылар төрт класқа бөлінеді:

Flagellata
Sarcodina
Sporozoa

1) 1000 ға жуық түрі денесі алмұрт тәрізді Flagellata класына жатады. Қимыл қозғалыс органеласы талшықтар, әртүрлі өкілдерінде олар 1-ден 8 ге дейін жетеді. Талшық дегеніміз жіңішке цитоплазмалық өскін, ол жіңішке фибрилдардан тұрады. Ол базальді денеге немесе кинетопластқа тіркеліп тұрады. Талшықтар талшықтармен алдыға қозғалады.

Талшықтардың қөректенуі хлорофил бар түрлерінде автотрофты, ал жоқтарында басқа жануарлардағыдай гереротрофты болады. Гетеротрофтылардың денесінің алдыңғы жағында ерекше ойық цитостом орналасады, осы арқылы талшық қозғалғанда, асқорту вакульне қорек түседі. Кейбір талшықтар қоршаған ортадағы еріген органикалық заттарды бүкіл денесі арқылы осмосты түрде сіңіреді.

Көбею түрлері. Көбейу көбінесе екіге бөлніу арқылы жүреді. Кейбір кезде көбейу өте тез жүреді.

2) Rhizopoda класының өкілдері жалғанаяқтылар көмегімен жүреді. Жалғанаяқтылар көбі теңіздерде мекендейді, кейбірі тұшы суда және топрақта мекендейді. Жалғанаяқтылар денесінің тұрақсыз болуымен ерекшеленеді. Тыныс алуы бүкіл денесі арқылы жүзеге асады. Көбейуі жыныссыз, және жынысты жолда орын алады.

3) Sporozoa кыласы өкілдерінң ерекшеліктері олрдың даму барсында спора түзеді. Бұл кластың өкілдерінің бәрі адам мен жануарлардың паразиттер. Олар әртүрлі жасушалар мен ұлпаларда паразиттік тіршілік жүргізеді. Бабезия қан споровиктер отрядына жатады.

4) Ciliata класының өкілдерінің қимыл-қозғалысы кірпікшелер арқылы жүзеге асады. Әдетте олардың саны көп болады. Мысалға кірпікшелі кебісшаде кірпікшелердің саны 2000-нан асады. Кірпікшелер талшықтар сияқты цитоплазалық өсінді түрінде болады. Кірпікшелі кебісшенің денесінде майда поралар орналасады, поралар арқылы кірпікшелер сыртқа шығып тұрады. Бұл класқа қарпайымдылардың жоғары дамыған түрлері жатады. Инфузория еркін жүзіп немесе бекінген түрде кездеседі. Олар ащыда, түщы суларда мекендейді. Инфузориялардың арасында омыртқасыз да омыртқалы жануарлардың паразиттері мекендейді. Паразиттік түрлері ірі қараның асқорту мүшесінде көп кездеседі. Барлық инфузорияда кемдегенде екі ядро болады. Үлкен ядро метаболиттік процесттерде ретеп отырады. Кіші ядро жынысты көбеюге қатысады. Инфузориялар көбеюі бөлніу арқылы жүреді, одан басқа жыныстық коньюгатция процесі жүріп отырады. Кірпікшелі кебісше күнделікті, ал басқа түрлері тәулігіне бірнеше рет бөлніп отырады. Қорек жануардың денесіне жасуша ауыз арқылы түседі, ол жерге кірпікшелердің қозғалсының көмегімен жетеді. Қорек асқорту вакуолі арқылы ыдыратылады. Қортылмаған қалдықтар сыртқа қарай шығарылады. Көптеген инфузориялар бактериялармен ғана қоректенеді.

Қарапайымдыларда еркін түрлерінен басқа паразиттік түрлері де кездеседі. Жыныссыз көбею жасушаның екіге бөлнуі арқылы өтеді. Қарапайымдылыарда көбінесе, жыныссыз көбею орын алады. Ол процес жасушаның екіге бөлнуі. Алғашында ядро бөлінеді. Ағзаның дамуының бағдарламасы жасушаның ядросында ДНҚ малекуласының жинтығы түрінде келеді. Ұрпақ жасушалардың әрқайсысы өздерінің ұрпақ белгілерінің көшірмесін алу үшін, әлі бөлінбеген жасушада ядро екі еселенеді. Содан соң жасуша бірдей екі бөлікке бөлінеді. Әр ұрпақ жасуша цитоплазмамен органелалардың тек жартысын ғана алады, бірақ аналық ДНҚ толық көшірмесін алады. Жыныссыз көбею оңай, әрі тез жүреді. Шын мәнінде, көбеюдің бұл түрінен көп жасушалы ағзаның дене өсуіндегі жасуша бөлінуінен айырмашылығы көп емес. Айырмашылық тек қана ұрпақ жасушалардың еркін ағза ретінде болып кетуі. Бөлніу кезінде аналық особь жойылмайды. Ол тек екі бірдей егіз особьтарға айналады. Мұндай жыныссыз көбеюде ағзаға маңгі өмір сүреді деп айтсақ болады. Ғалымдар бірнеше он жылдықтар бойы ақпараттары бірдей қарапайымдылардың культурасын сақтап келе алды. Қоршаған ортаның өзгеруіне бірдей ақпаратты ағзалар төтеп бере алмағандықтан қырылып қалды. Бұл дағдарысқа жол бермеуге тек жыныстық процес көмектеседі.

Жыныстық көбею және редукциялық бөлніу. Жыныстық процес екі ұрпақтан ақпараттық қосындысынан тұрады. Көптеген қарапайымдыларда бұл процес екі жасушаның қосыу нәтижесіндегі түзілетін гамета арқылы жүреді. Талшықтар арқылы бір гамета екінші қарама қарсы жыныстың гаметасын тауып алады. Екі гамета толығымен қосылып, зигота жасушаны түзеді. ДНҚ-нің саны шексіз көбеймеуі үшін керсінше редукциялық бөлніу процесі жүреді. Бұл бөлніудің түрінде жасуша бөлінердің алдында ДНҚ екі еселенбейді. әр ұрпақ жасуша ақпараттың тең жартысын алады. Соның арқасында әртүрдің жасушасындағы ақпараттық материал кем дегенде екі есе өзгереді. Жыныстық көбею уақытпен энергия алады. Бір ұрпақ сапалы өзгергіштік қасиетке йе болады. Ұрпақ жасушалар аналық жасушалардан күштірек болу мүмкіндігі артады. Осы жұмысымда Protozoa геномдарының жалпы түрлеріне және олардың геномдарына жалпы түсінік жаздым. Протисттердің геномындағы гендердің орташа тығыздығы 2 еседен көп болған, 228 ген/МЬр ( Р. falciparum ) және 779 ген /Mbp ( B. bovis ) . Әбір геномда хромосомадағы ген тығыздығы ұқсас болған, дәлірек айытқанда стандартты ауытқу 7%-дан аз болған. Алайда, В. Bovis геномында 3 хромосомасында ген тығыздығы 445ген /Mbp болған, бұл дегеніміз басқа үш хромосомадағы орташа ген тығыздығынан 2 есе аз деген (887±25) . Ал интронды гендердің орташа үлесі мен интронды емес гендердің орташа ұзындығын барлық хромосомаларда жақын болған.

Cryptosporidium Hominis жоғары қабілеттілік ретті, жиналыс және аңдатпа туралы Хоминис штаммон С. TU502 генома жасалынды Вирджиниа достастық университетінде, биологиялық қиыындықтарды зерттеу орталығы. Тек 12 рет қана ретті генома қамтытады жіне Бакуда дайын болған 8-краттық геномалық клондармен қамтытады. Геном организімі шамамен 9, 2 Mbp таралған қзінін 8 хромосомасында. 99% пйызы генома контиксте жиналған және орналасқан андатпа сатыда.

Cryptosporidium Parvum міндеті ішкі жасуша паразит түрі Аписомплекста бар қиын өмірлік цикл, бірнеше жынысты және жыныссыз кезең дамуы. Бұл адамда қатты диареялық ауру туғызады (бүкіл әлемде бұл ауру 3-ші негізгі сатысы диареялардың. ) және жануарларда да, ол өте негізгі патогенге айналды бүкіл әлем өзінін арулары үшін ЖИТС-пен. Бұган қарамастан, бұл паразит туралы аз мағлұмат бмология және нақты химио - немесе иммундық терапия емдеу үшін криптоспоридиозді әлі қартыру керек /5/.

1. 2 Protozoa түрлерінің гендеріне сипаттама

Cryptosporidium Hominis геномы

Шығу тегі: Eucoryot; Alveolata; Apicomplexa; Coxcidess; Eukaryota; Alveolata; Apicomplexa; Eucoccidiorida; Eimeriorina; Cryptosporidiidae; Cryptosporidium; Cryptosporidium Hominis бұл аписомплексан паразиті, адамдарда гастроэнтерит және диарея аурулары туғызады. Тропикалық өнірлерде қте көп таралған, ал солтүстік Америка өнірлерде суық климат сирек кездеспейтін құбылыс. Бірақ бұл ауру жауапкершілікті өзіне алмайд қайтыс болған әлсіз адамдармен балалар үшін. Жоғары қабілеттілік ретті, жиналыс және аңдатпа туралы Хоминис штаммон С. TU502 генома жасалынды Вирджиниа достастық университетінде, биологиялық қиыындықтарды зерттеу орталығы. Тек 12 рет қана ретті генома қамтытады жіне Бакуда дайын болған 8-краттық геномалық клондармен қамтытады. Геном организімі шамамен 9, 2 Mbp таралған қзінін 8 хромосомасында. 99% пайызы генома контиксте жиналған және орналасқан андатпа сатыда. /6/

Cryptosporidium Parvum геномы

Шығу тегі: Eukaryota; Alveolata; Apicomplexa; Eucoccidiorida; Eimeriorina; Cryptosporidiidae; Cryptosporidium; Cryptosporidium Parvum

Геном протозой паразиттері Parvum Криптоспоридиум қазырғы уақытта аңдатпа жолмен кеңейтілген генетика аналитикалық орталық (Agac) Миннесот Университетте (УМН) NIAID арқылы қаржыландырылған. Соған қосымша күш, аяғында эшафот геномдық клонды қамтытады ДНК тексерісі (Миннесот Штат Университетінде орындайды) . C. Parvum ядролық геном шамамен құрайды 10, 4 Мб, 8 хромасоманын өлшемі құрайды 1, 04 тен 1, 5 Мб дейін. Апикомплекс С. Parvum нан қарағанда пластид геномасы жоқтығынан ұсынады. C. Parvum міндет ішкі жасуша паразит түрі Аписомплекста бар қиын қмірлік цикл, бірнеше жынысты және жыныссыз кезең дамуы. Бұл адамда қатты диареялық ауру туғызады (бүкіл әлемде бұл ауру 3-ші негізгі сатысы диареялардың. ) және жануарларда да, ол өте негізгі патогенге айналды бүкіл әлем өзінін арулары үшін ЖИТС-пен. Бұган қарамастан, бұл паразит туралы аз мағлұмат бмология және нақты химио - немесе иммундық терапия емдеу үшін криптоспоридиозді әлі қартыру керек. Секвенирование генемді криптоспоридий мағыналы ақпарат бар структуралық геном және ұйым, парозит және патогенез өзара әрекет қабылдайды, сонымен қатар мақсат дәрі - дәрімектерді істеп шығарады. /7/

Plasmodium falciparum геномы

Даму үрдісі : Eukaryota, Alveolata, Apicomplexa, Aconoidasida, Haemosporida, Plasmodium, Plasmodium (Laverania), Plasmodium falciparum

Малерий плазмодиінің малерий паразитін адам геномына әсер етуін зерттеу үшін 1996 ж. Халықаралық консорциумы құрылды. Осы зерттеу бағдарламасына қатысатын бір топ орталықтар келесі жерлерде орналасқан: генонды зерттеу институты BMC АҚШ хромосоманың медициналық зерттеу орталықпен бірлестікте Санджер институты және Стэнфорд институтының Стэнфорд ген техникалық орталығы малярия тобына арналған генондық ақпаратты пайдалануды жеңілдету үшін Плазмо ДВ деген орталықталған ақпарат база құрылды. Plasmodium falciparum 3D7 штамының аяқталған геноны Табиғат журналында 2002 ж. жарық көрген. (3 қазан, 419 (6906, 498-511) және оны Ген банкімен Ref Seq нұсқасында болды. Массачусетс институты және Гарвард институты П. Фальсипарумның 11 түрін көрсетеді, ол жалпы генондық оқуларды пайдалануға мүмкіндік береді. 3D7 штамды П. Фальсипарум геномы бұл жерде ықпалды генон ретінде берілді: P. flaciparum геномы 23мб, 1414 хромосомамен және АТ-бай болып жинақталған. P. flaciparum қатысты хромосомдарға негізделген страегия таңдалған және хромосомдар реттелген орталықтарда бөлінген. Барлық басқа Plasmodium түрлері реттелген барлық генондарда бөлек қарастырылған.

Plasmodium falciparum Протазон паразит пластодиомы адам малариясының себепші агенті. Бұл паразит комплекті өмір циклы бар, олар омыртқалы және омыртқалы емес болып бөлінеді. Адамдарға Anopheles масасының қаны арқылы тарайды. Бұл P. flaciparum адам өмір циклінде гаплоидтық болып табылады. Ядролық генонды қосқанда, П. Ф. 5, 9 kb митохондриалды DNA мен 35 kb пластид домалақ DNA -дан құралды.

Plasmodium falciparum хромосомалары дағдылы емес құрылымға ие. Хромосомалар транскрипципциялық гендердің орналасқан және subtelomeres -ке сәйкес келетін полиморфтық ауданға орталық жинақтау ауданына жинақталған. /8/

Plasmodium yoelii.

Даму үрдісі: Eukaryota, Alveolata, Apicomplexa, Aconoidasida, Haemosporida, Plasmodium, Plasmodium (vinckeia), Plasmodium yoelii .

Геномдық зерттеу институты әскери теңізді Медициналық зертеу орталығымен қоса маляля паразитінің кеміргіштер геномі Plasmodium yoelii . зертеуге мүмкіншілік алды. Мәліметтер АҚШ тің қорғаныс министрлігімен берілген болатын. Plasmodium yoelii геномының секвенирлеу мақсаты үкімет тің төменгі деңгейінде орналасқан. сол геномға байланысты кітапхана плазмидтер және клондар кітапханасынан алынған болатын. Соңында олар аннотация ретінде қолданып жүр. Ондай ақпараттар гендерді жылдам зертеуге, жылдам ашу үшін қажет және бұл ақпараттан геном жайлы толық білім алуға, оның құрлысын білу қиын. Бұл реттеушік бағдарлама маляриялық плазмодидің ауруын тудырушы геномын толық масштаб секвенирлеудің толықтырылуы болып табылады. Соған қоса осы секвенирлеу P Vivax, N, bergli chabaudi сияқты плазмоди геномдарының эволюциясын терең түсінуге мүмкіндік береді. Алғашқы салыстырмалы геномдық анализдің көрсетуі бойынша осы ағзалардың геномдары өз құрлымы, әрі мөлшері 23 MB) ұқсас. Plasmodium yoelii . Геномы Gen Bank AABLO1 номері қосылады. 2 kb-ден көп contigs, жалпы реттеу геномының 87%-ға жуық болғандықтан автоматты түрде аннотация болады: автоматтандырылған табиғатқа сәйкес, аннотацияларды қайта қарастыру қажет.

Dictyostelium discoideum геномы

Даму үрдісі : ; Amoebozoa; Mycetozoa; Dictyosteliida; Dictyostelium; Dictyostelium discoideum

D. discoideum Ax4 геномының қысымы; жиналысы және аннотациясы Мар viewer-де 2. 5 геномының нұсқасын, халықаралық Тізім D. discoideum Консорциумы мен dictyBase-де көрсетіледі. Discoideum геномының 34Мбит-ке жуық ауырлығына байланысты әрбір 6 хромосома жеке клонданған. Ядролық геномдарға қоса дисцодеумнің тағы бірнеше данада құрамында гендік-инженерлік гені бар экстрахромосомалық элементтері мен 55КВ митохондриялы геномы бар. Мар viewer дисцодеум геномын құрастыру салдарында оның графикалық қызметтерін қамтамасыз етеді. Бірқатар карта ерекшеліктеріне NCBI contigs, CpG islands , гендер, RefSeq transcripts, UniGene кластерлер, экологиялық қауіпсіз технологиялар да кіреді. бүтіндей геномның немесе хромосомаларға қатысты мәліметтер жинау арқылы белгі ерекшеліктерін таба аласыз. Нәтижелер кесте түрінде көрсетіледі. Нәтиже кестесіне ерекшелігі қосымша құжаттмалар контекстінде берілетін хромосомалардың графикалық көрінісі жайлы ақпарат кіреді. Өз дисплейіңізді қалпына келтіру үшін жеке хромосомаларды көрсетіп тұратын «Карталар және Түзетулер» терезесін пайдаланыңыз. Кең құжаттама мен оқу құралдары мәліметтерді суреттеу мақсатында ұсынылады.

Leishmania

Даму үрдісі : : Eukaryota; Euglenozoa; Kinetoplastida; Trypanosomatidae; Leishmania; Leishmania braziliensis species complex; Leishmania braziliensis

Leishmania адам ауруының кең спектрін тудыратын, терідегі аяқ астынан пайда болған аса қауіпті жарақаттарды анықтайтын протозон болып табылады. Жұғу деңгейі әлем бойынша 2 миллионға жуық әлемнің 1/10 бөлігі жұқтыру қаупінде. Лейшманиоз Солтүстік және Батыс Африкада, Таяу Шығыста, Еуропа бөлігінде, сондай-ақ Орталық және Оңтүстік Америкадағы эпидемиялық ауру болып табылады. Соңғы 5 жыл ішінде Судан елінде бұл ауру эпидемиясы бүкіл тұрғындардың 10%-ын өлімге әкеп соқты.

Москиттердің 30-ға жуық түрі көпшілікке инфекция жұқтырады. Солардың ішінде инфекция жұқтырған адамдар, кеміргіштер сияқты жабайы аңдар мен ит тәрізді үй жануарлары бар. Leishmania кейбір түрлері зоонозды болып табылады (яғни жануарлардан адамдарға беріледі), және адамға табиғи берілу циклі кенеттен төнген жағдайда ғана жұғады. Дегенмен, тасымалданудың антроптық формасында адам жалғыз табиғи резервуар болып табылады.

Лейшмания паразитінің геномы Фриедлин деформациясының негізі Leishmania желі геномында халықаралық Консорциумда қаланды.

Бұл организмде 36 хромосомадан тұратын кариотип бар, демек, жалпы алғанда геном ДНҚ-сы 32. 8 Мбайтты құрайды. Жеке хромосомалар импульстік гель - электрофорез көмегімен шығарылып тасталды. Барлық 36 хромосоманы тізбектеу аяқталған соң бос орындар толды. Геном әлі де қысқартылуда және 8. 272 ген әлі күнге дейін гаплоидті геномда анықталу үстінде. Хромосоманың толық жазбасы GenBank және RefSeq-те сақталған.

Геномдардың экзон-интрондық ұйымдасуының зерттелуі, интрондардың жаңа құрылымы мен олардың жаңа функциаларының ашылуымен байланысты. Олардың гендерде санының өсуіне байланысты интрондардың ұзындықтары 80-100 нуклеотидке дейін өсті және ұзындықтары 400 нуклеотидке дейін кеміп отырды. Экзондардың ұзындықтарының гендерде осылай өзгеруі, экзондардың ұзындықтарының максимум 60-120 нуклеотидке дейін өсетінін байқауға болады. Маңызды мәселе болып, интрондар мен экзондардың ұзындықтары интрондардың гендердегі саныны байланысты екенін анықтау болып табылады, себебі сплайсинг процесі мен гендер экспрессиясына әсер етуі мүмкін.

1. 3 Генетикалық тізбекті анализдеу

... жалғасы

Сіз бұл жұмысты біздің қосымшамыз арқылы толығымен тегін көре аласыз.