Жануарлардың гендерінің сипаттамасы

Кіріспе ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..3
1Қарапайымдылар сипаттамасы ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .4
2Babesia bovis сипаттамасы ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..8
3 Ағзалардың гендерінің экзон.интрондық ұйымдасуын салыстырмалы талдау ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... .9
4 Ақпараттар мен әдістер ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 12
5 Нәтижелерді сипаттау ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..13
6 Қорытынды ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ...21
Қолданылған әдебиеттер ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..22
Биоинформатика ғылым ретінде молекулалық биологияның, генетиканың, математиканың және компьютерлік технологиялардың түйіскен жерінде пайда боған ғылым. Оның басты мақсаты – біріншіден,нуклеин қышқылы мен белоктардың функциясы мен құрылымы туралы мәліметтердің систематизациясы және анализі үшін есептеу алгоритмдерін жасау.Биоинформатикалық әдістер осыншама көп мәліметтерді тек өңдемейді, сонымен қатар әдеттегі әдістерді қолданған кезде байқалмайтын заңдылықтарды анықтауға, гендердің және олар кодтайтын белоктардың функциясын болжауға, клеткадағы гендердің өзара арақатынасын, дәрі-дәрмектерді конструкциялауға мүмкіндік береді.Тұңғыш рет 1975 жылы "лямбда" фагының дамуын реттеу сандық моделі жасалды.Оның геномы 48 геннен тұрады,( қазіргі кезбен салыстырғанда өте аз), бірақ реттегіш жүйесі күрделі. Осы және басқа да күрделірек жүйелер де копьютерді қолдануды қажет етеді. Сөйтіп, математикалық биологиядан жаңа тармақ-биологиялық жүйелерді зерттеуге информациялық технологияларды қолдануға негізделген биоинформатика бөлініп шықты.Биоинформатиканың дамуына үлес қосқан цитология және генетика институтының РАН-ның Сібірлік бөлімшесін атап кету керек. Бұл ғылымды компьютерлерсіз елестету қиын.Қазіргі кезде мәліметтер жинақталуда, ДНҚ молекуласының геномының бірінші реттік орналасу тәртібі туралы ақпараттар көбеюде.Қазіргі кезде "биология in silico" деген термин пайда болды, оның дәл аудармасы- кремнийдегі биология дегенді білдіреді, басқаша айтсақ, компьютерде биологиялық эксперименттер жасау.Биоинформатика- зерттеу жұмысын жасамай, табиғатты бақыламай тұжырым жасау тәсілі. Әрине, барлығының негізінде геном жатыр: организмнің геномын біліп қана сенімді тұжырым жасауға болады.Жаппай жасалған эксперименттердің мәліметтерін индустриалды ағыннан аламыз:ол- геномдарды анықтау(расшифровка), әртүрлі организмдерде, клеткаларда, әртүрлі жағдайда белоктар мен белоктардың әрекеттесуін анықтау.Бұрын осындай мәліметтер алу үшін ерекше эксперименттер жасалатын, мысалы орташа бактерияларда 3000ген бар, ал адамдарда бір саты жоғары, яғни 30 000 , ал белок саны одан да көп, енді осыншама белоктардың арасында екі-ақ белоктың өзара әрекеттесуін анықтау үшін қаншама эксперимент жасау керек? Әсіресе әрекеттеспейтін белоктарды анықтауға уақыт кететіні қиын. Массалы(массовый) эксперимент дегеніміз- бір уақытта бірнеше робот жасайтын тәжірибелер. Бірақ осы кезде көптеген дау- кездесоқ қателер туады, осы қателердің ішінен сенімді мәліметтер алу – биоинформатиканың мақсаты [1].
1. http : //www.nki.ru/archive/articles/310
2. Догель В. А. Общая протистология // М.: Советская наука.- 1951. – 603с.
3. Томас Вильке Паразиты // ГЕО.-2000.- №2.- с. 44-54.
4.Константинов Г. С., Блохин А. В. О морфологии амебиаза. // Арх. пат.- 1988.- №4.- с. 44-50.
5. Воробьев А. А. и др. Микробиология // М.: Медицина.- 1994. - 288с
6. Gray JS. Identity of the causal agents of human babesiosis in Europe//Int J Med Microbiol.- 2006.-296(Suppl 40).-P. 131–136 .
7. Jones SH, Lew AE, Jorgensen WK, Barker SC. Babesia bovis: genome size, number of chromosomes and telomeric probe hybridization // Int J Parasitol. -1997.-№ 27.- P. 1569–1573.
8. Кабдуллина А.А., Тауасарова М.К., ИващенкоА.Т. Разнообразие геномов одноклеточных эукариот по экзон-интронной организации генов Вестник КазНУ. Серия биол. - 2008. - №1(19) . - C.249
9.Waller RF, Keeling PJ, Donald RG, Striepen B, Handman E, et al Nuclear-encoded proteins target to the plastid in Toxoplasma gondii and Plasmodium falciparum // Proc Natl Acad Sci U S A. – 1998.- № 95. – P. 12352–12357.
        
        МАЗМҰНЫ
Кіріспе...............……….……………………………………………………….…..3
1Қарапайымдылар сипаттамасы…………………………………………………4
2Babesia bovis сипаттамасы...……………………………………………....….....8
3 Ағзалардың гендерінің экзон-интрондық ұйымдасуын салыстырмалы
талдау………………………………………………………………………............9
4 Ақпараттар мен әдістер…………………………………………………...….12
5 Нәтижелерді сипаттау…………………………………………………………13
6 ... ... ... ... ... ... және ... технологиялардың түйіскен
жерінде пайда боған ғылым. Оның басты ...... ... белоктардың функциясы мен құрылымы ... ... және ... үшін ... ... әдістер осыншама көп мәліметтерді тек өңдемейді,
сонымен қатар әдеттегі әдістерді ... ... ... заңдылықтарды
анықтауға, гендердің және олар кодтайтын белоктардың функциясын болжауға,
клеткадағы ... ... ... ... конструкциялауға
мүмкіндік береді.Тұңғыш рет 1975 жылы "лямбда" фагының дамуын реттеу сандық
моделі жасалды.Оның геномы 48 геннен ... ... ... ... аз), ... реттегіш жүйесі күрделі. Осы және ... да ... де ... ... ... ... ... математикалық
биологиядан жаңа тармақ-биологиялық жүйелерді зерттеуге ... ... ... ... бөлініп
шықты.Биоинформатиканың дамуына үлес қосқан ... және ... ... ... ... атап кету ... Бұл ғылымды
компьютерлерсіз елестету қиын.Қазіргі кезде мәліметтер ... ... ... ... ... ... тәртібі туралы ақпараттар
көбеюде.Қазіргі кезде "биология in silico" ... ... ... ... оның
дәл аудармасы- кремнийдегі биология дегенді ... ... ... ... эксперименттер жасау.Биоинформатика- зерттеу
жұмысын жасамай, табиғатты бақыламай ... ... ... Әрине,
барлығының негізінде геном жатыр: организмнің геномын біліп қана ... ... ... жасалған эксперименттердің мәліметтерін
индустриалды ағыннан аламыз:ол- геномдарды анықтау(расшифровка), ... ... ... ... белоктар мен белоктардың
әрекеттесуін ... ... ... алу үшін ... ... ... орташа бактерияларда 3000ген бар, ... бір саты ... яғни 30 000 , ал ... саны одан да көп, ... белоктардың арасында екі-ақ белоктың өзара әрекеттесуін анықтау
үшін қаншама эксперимент жасау ... ... ... ... ... кететіні қиын. Массалы(массовый) эксперимент дегеніміз- бір
уақытта ... ... ... ... ... осы кезде көптеген дау-
кездесоқ қателер туады, осы қателердің ішінен ... ... алу ... ... ... ... сипаттамасы
Бір жасушалы организмдердің атқаратың қызметтері көп жасушалыларға
ұқсайды, қоректенеді, қозғалады, ... ... көп ... ... ... бір жасушасы жүзеге асырады. Бір ... ... ... оларды бір патшалықастыға
бөлген. Қарапайымдылардың типіне 15000 ... түрі ... ... тұщы ... топырақта кездеседі. Бос күйінде және паразиттік
түрде кездеседі. Олардың қауыпты аурулар туғызытын ... ... ... ... ... бір жасушадан тұрады. Пішіні
әр ... ... ... ... ... ... екі ... симметриялы
немесе тұрақты пішіні тіпті болмауы ... ... ... ... ... 2-4 мк-дан 1,5 мм дейін кездеседі,
кейбір особьтары 5 мм ал ... ... 3см ... ... ... мен ... тұрады. Цитоплазманың
сырты цитоплазмалық мембранамен қоршалады, оның ... ... эндо ... тор, ... ... ... орналасады.
Қарапайымдыларда бір немесе бірнеше ядро болады. ... ... ... ... көбейуі түріде кездеседі. Ол зиготта ... ... ... ... кірпікшелер,
жалған аяқтар атқарады немесе тіпті болмайды. Қарапайымдылар ... ... ... өкілдері сияқты гетеротрофты, бірақ олардың
арасында да автотрофты түрлері кездеседі.
Қарапайымдылардың қоршаған ... ... ... ... ... яғни ... түзу қабілеті. Циста түзілу
кезінде қимыл-қозғалыс органоидтары жойылады, көлемі ... ... ... ... ... ... Ол ... күйге түседі
де, қолайлы жағдай ... ... ... ... ... өмірге
оралады [2]. Инцистену қабілеті қорғаныс қасиетінде ғана ... ... да ... көп. ... қарапайымдылар овоциста
түзеді және ... ... ... ... [ 3 ... ... ортасы әртүрлі болып келеді.
Олар теңіздер, тұщы ... ... ... да ... ... төрт ... бөлінеді:
1) Flagellata
2) Sarcodina
3) Sporozoa
4) Infusoria немесе ... 1000 жуық түрі ... ... ... ... ... ... қозғалыс органеласы талшықтар, әртүрлі өкілдерінде ... 8 ... ... Талшық дегеніміз женішке цитоплазмалық өскін,
ол женішке ... ... Ол ... ... немесе
кинетопластқа тіркеліп тұрады. ... ... ... қоректенуі хлорофилл бар түрлерінде автотрофты,
ал жоқтарында басқа ... ... ... ... ... жағында ерекше ойық цитостом
орналасады, осы арқылы талшық ... ... ... ... ... ... ... ортадағы еріген органиқалық
заттарды ... ... ... ... ... ... ... Көбейу көбінесе екіге бөліну арқылы жүреді.
Әдетте бір особь екі ұрпақ ... ... ... жүреді. Кейбір
кезде көбейу өте тез ... [ 2 ... ... ... ... ... көмегімен жүреді.
Жалғанаяқтылар көбі ... ... ... тұщы суда ... ... Жалғанаяқтылар денесінің тұрақсыз болуымен
ерекшеленеді. Тыныс алуы бүкіл ... ... ... ... ... , және жынысты жолыда орын алады [ 4 ... Sporozoa ... ... ерекшеліктері олардың даму
барысында ... ... Бұл ... ... бәрі адам ... ... Олар ... жасушалар мен ұлпаларда паразиттік
тіршілік жүргізеді. Бабезия қан споровиктер отрядына жатады.
4) Ciliata класының өкілдерінің ... ... ... ... ... олардың саны көп болады. ... ... ... саны ... ... Кірпікшелер талшықтар
сияқты цитоплазмалық өсінді түрінде болады. ... ... ... ... ... поралар арқылы кірпікшелер ... ... Бұл ... ... ... ... ... жатады.
Инфузория еркін жүзіп немесе бекінген түрде кездеседі .Олар ащы да тұщы
да суларда мекендейді. Инфузориялардың ... ... ... сирек
паразиттер кездеседі[ 2 ]. Инфузориялардың арасында омыртқасыз да омыртқалы
жануарлардың ... ... ... түрлері ірі-
қаралардың асқорыту мүшесінде көп ... [ 3 ]. ... ... ... екі ядро ... Үлкен ядро метаболиттік процестерді ... Кіші ядро ... ... ... Инфузориялар көбеюі бөліну
арқылы жүреді. Одан басқа жыныстық конъюгация процесі жүріп ... ... ... ал ... ... ... ... рет
бөлініп отырады. Қорек жануардың денесіне жасуша ауыз ... ... ... ... қозғалысының көмегімен жетеді. Қорек асқорыту ... ... ... ... ... ... шығарылады.
Көптеген инфузориялар бактериялармен ғана қоректенеді .
Қарапайымдыларда еркін түрлерінен басқа ... ... ... ... ... ... екіге бөлінуі ... ... ... ... көбею орын алады. Ол процесс жасушаның
екіге бөлінуі. Алғашында ядро бөлінеді. Ағзаның ... ... ... ДНК ... ... ... ... Ұрпақ
жасушалардың әрқайсысы өздерінің ұрпақ ... ... алу ... бөлінбеген жасушада ядро екі еселенеді. Содан соң жасуша бірдей екі
бөлікке бөлінеді. Әр ... ... ... мен органеллалардың тек
жартысын ғана алады, бірақ ... ДНК ... ... ... Жыныссыз
көбею оңай, әрі тез жүреді. Шын мәнісінде, көбеюдің бұл түрінен көпжасушалы
ағзаның дене ... ... ... ... көп ... Айырмашылық
тек қана ұрпақ жасушалардың еркін ағза ретінде болып ... ... ... ... Ол тек екі бірдей егіз особьтерге айналады. Мұндай
жыныссыз көбеюде ағза ... өмір ... деп ... ... ... ... ... онжылдықтар бойы ақпараттары ... ... ... келе ... ... ... жануарлар үшін қорек көлемі
мөлшерлі болғандықтан, ұрпақтардың ... ... тірі қала ... ортаның өзгеруінен бірдей ақпаратты ағзалар төтеп ... ... ... Бұл ... жол бермеуге тек ... ... ... және ... бөліну. Жыныстық процесс екі
ұрпақтың ақпараттық қосындысынан тұрады. Көптеген қарапайымдыларда ... екі ... ... ... ... ... арқылы
жүреді. Талшықтар арқылы бір гамета екінші қарама-қарсы жыныстың гаметасын
тауып ... Екі ... ... ... зигота жасушаны түзеді. ДНК-ның
саны шексіз көбеумеуі үшін керісінше редукциялық бөліну процесі жүреді. Бұл
бөлінудің түрінде жасуша бөлінердің ... ДНК екі ... Әр ... ... тең ... алады. Соның арқасында әртүрдің
жасушасындағы ақпараттық ... кем ... екі есе ... ... ... пен ... алады .Бірақ ұрпақ сапалы өзгергіштік қасиетке
ие болады, осының арқасында ... ... ... ... ... мүмкіндігі көбірек болады.
Үлкен және қарапайым жануарлардың ... ... ... болсақ екеуі тең түрде жүреді. Қарапайымдылар тау кендерін
құрастырушы болып саналады. ... 600 ... жыл ... ... болды. Көпшілік тірі ағзаларда оларды жауларынан қорғайтын
қаңқа пайда болды.Содан ... ... ... ... өле ... ... ... түбіне сансыз раковиналар жиналып, ... ... түзе ... ... су ... роль ... Су экосистемасында қоректік тізбек микроскоптық
балдырлардан ... ... ... ... Олар су экосистемасындағы жануарлармен қоректенетін шабақтар
майда шаяндардың ... ... Өлі ... мен ... теңіз
түбіне түскен қалдықтарын су түбінде мекендейтін ... ... ... әр миллиметрінде мекендейтін қарапайымдылар да ... ... ... мен ... ... ... арттырып
отырады. Қарапайымдыларсыз өсімдікпен қоректенетін ... ... ... Олар ... асқорыту мүшелерінде мекендей отырып
оларға ... ... ... Мысалы термиттің ас ... ... ... ішегінде және сиырдың асқазаннында мекен ... ... ... ... пайдаланады.
Қорыта айтқанда қарапайымдылар жануарлардың біршама қасиеттеріне
ие ... ... ... ағза ... бір ... ... Олардың
майда болуы ортамен зат алмасуын денесі ... ... ... ... қызметтерді арнайы органелалар жүзеге асырады [ 2 ].
Қолайссыз жағдай туғанда ... ... ... ... ... ,ал ... ... ұрпақ қалдырады .Олардың тіршілігі
барысында жынысты және жыныссыз этаптары болады. Ерекше ... ... ... ... Қарапайымдылар ауыр формалы ... ... ... [ 5 ].
2 Babesia bovis ... ... малдың және адамның қан эритроциттерін
зақымдаушы жасуша ішілік паразит. ... ... ... ... аз кездеседі бірақ өте қауіпті болады . Жануарлардың бабезиозын
ең бірінші Румынияның ғалымы ... ... ... өте келе әлемнің
басқада ғалымдары зерттей бастады. ... B.bovis ... ... ... жүреді. B.bovis көлемі мен пішіні әр ... ... ... ... ... ... қабықшасының бойында
орналасады. Жұп ... ... ... ... ... ... ... он пайызға дейін барады. B.bovis ... ... ... ... ... ... Аурудың иесі ретінде қоздырғышқа сезімтал
жануар және керсінше ауруға төзімді иелері болады. Ауру ... ... ... ... ... жүреді, сирек операция кезінде қан арқылы
таралады. B.bovis ... ... ит ... Ixodes ricinus ... ... B.bovis ішек ... және жасуша ішінде жыныссыз
көбейіп жүреді. Кененің ішінде B.bovis ... және ... ... ... кезінде B.bovis жануардың қанына кененің
сілекейі арқылы таралады, ол эритроцитке еніп көбие бастайды [ 6 ... ... төрт ... ... , 9.4 Mb ... . Бұл
мәлеметтер әдеттегідей гель ... ... ... ... ... ... 1.4 , 2.0 , 2.8 және 3.2 Mb болады. Ең ... ... ... ... екі ... ... үлкен физикалық ойығы болады. Гель ... ойық ... 150kbp ... ... бес ... болады, олардың
көлемі 12kbp-дан 28kbp-ға ... ... ... мен ... ... ... ... жыйналып бір
ойық болады . Геномында А-T аймақтар көп ... . ... ... ... ... ... ... геномын шығару үшін , ... b.bovis ... ... әдіс ... толық геномды табамыз.
Геннің моделі мен геномдық ... ... әлі ... ... ... ... геномына ұқсас болып келеді. T.parva ,
T.annulata мен P.falciparum толық апикомплексальды ... ... ... [ 7 ].
3 ... гендерінің экзон-интрондық ұйымдасуын с алыстырмалы
талдау
Соңғы жылдары біржасушалық эукариоттар геномдарының ... ... ... ... анықталып, онға жуығы секвендеу кезеңінде тұр.
Бұл ағзаларды зерттеуге кызығушылық ... бар ... ... ... ... кейін арта түсті. Соңғы жағдай жоғары және ... ... ... ... және эволюциондық
аспектілерде анықтауға мүмкіндік береді. ... ... ... бар ... ... ... эукариоттар гендерінің экспрессиясы
үшін болашағы зор биотехнологиялық объекттер болып табылады, себебі, олар
интрондарды ... ... ... ... ... кодтайды.
Төменгі эукариоттар секвенделген геномдарын зерттеу нәтижесінде олардың
құрылымының алуан түрлілігі анықталған. Бұл ... ... ... ... ... ... ... асу
механизмдерімен, интронды гендер ... ... ... ... экзон-интрондық ұйымдасуының алуан ... ... ... тән ... ... ... зерттеу
өте маңызды болып табылады.
Қазіргі таңда, келесідей төменгі саңырауқұлақтар геномдарының толық
кезектері зерттелген: Aspergillus fumigatus, Candida glabrata, Cryptococcus
neoformans, ... ... ... cuniculi, Eremothecium
gossypii (Ashbya gossypii), Kluyveromyces lactis, Magnaporthe ... crassa, ... ... Schizosaccharomyces pombe,
Ustilago maydis, Yarrowia lipolytica и протистов: Babesia bovis ... natans, ... parvum, ... ... lamblia, ... theta, Hemiselmis andersenii, ... ... ... ... major, ... ... ... Tetrahymena thermophila, Theileria
parva, Trypanosoma brucei ... ... 1, 2, 3, 4, 5, 6–9, 10–14, 15 және одан да ... бар ... таңдауы құрылған. Анализ барысында қайталанған гендердің
тек бір копиясы пайдаланылған. Баламалы сплайсингті ... ең ... ... ... қосындысы үшке бөлінбейтін гендер мен 5’ және
3’ трансляцияланбаған бөліктердегі интрондар мен экзондар ... (lex) мен ... (lin) ... ... экзондардың гендегі
ұзындықтар қосындысы (Lex), ген ұзындығы (Lgn), экзондардың гендегі ұзындық
үлесі (Lex/Lgn), интрондардың гендегі саны (Nin) және ... ... (Ngn) ... ... ұзындығы 1–20, 21–40, 41–60 н., солай 400 н-
ге дейінгі және 400 н-нен ұзын интервалдардағы ... мен ... ... ... саңырауқұлақтардың геномының хромосомалар құрылымының
алуан түрлілігі.
Зерттелген геномдар көлемімен, хромосома санымен және экзон-интронды
ұйымдасуы бар ... ... ... ... ... ... гетерогенді болып келеді. Мысалға, хромосомдардың ... ең ... M. grisea ... – 6,163 Мbр және ең кіші ... геномында – 0,754 Мbр, яғни олардың өз арасындағы ... ... ... ... Ең ... және ең кіші хромосомдар ұзындығы Y.
lipolytica геномында 18,3 есеге ... және D. hansenii мен M. ... 1,9 ... ... жеткен. Алайда, әрбір геномда 1 Мbр
есептегенде гендер тығыздығы барлық хромосомаларда ұқсас ... ... ... ... - 6% және одан да аз болуы куә. Геномдардағы ген
тығыздығы 247 ... (N. crassa) мен 540 ... (E. ... ... ... ... гендердің орташа тығыздығы геном
көлеміне мен интронды гендер үлесіне теріс коррелиренген. ... ... 0,78 (р

Пән: Биология
Жұмыс түрі: Материал
Көлемі: 22 бет
Бұл жұмыстың бағасы: 300 теңге









Ұқсас жұмыстар
Тақырыб Бет саны
Онкогенез.Канцерогенез13 бет
Харди – Вайнберг заңы. Популяциялар динамикасы4 бет
Адам генетикасы4 бет
Вирустар туралы12 бет
Егіздер психогенетикасының зерттеу объектісі жайлы3 бет
Ет, құс, жұмыртқа және олардың өнімдерінің химиялық қауіпсіздігінің көрсеткіштері15 бет
Жануарлар гаметогенезі8 бет
Органикалық дүниенің даму тарихы6 бет
Сомалық будандастырудың принциптері4 бет
Трансгенді өнімдер5 бет


+ тегін презентациялар
Пәндер
Көмек / Помощь
Арайлым
Біз міндетті түрде жауап береміз!
Мы обязательно ответим!
Жіберу / Отправить


Зарабатывайте вместе с нами

Рахмет!
Хабарлама жіберілді. / Сообщение отправлено.

Сіз үшін аптасына 5 күн жұмыс істейміз.
Жұмыс уақыты 09:00 - 18:00

Мы работаем для Вас 5 дней в неделю.
Время работы 09:00 - 18:00

Email: info@stud.kz

Phone: 777 614 50 20
Жабу / Закрыть

Көмек / Помощь